Yohan Le Bourhis commence le rugby à Surgères, avant de rejoindre La Rochelle en cadets.

En 2014, il rejoint Biarritz où il fait ses débuts en équipe première et s'impose comme le titulaire au poste d'ouvreur.

Après trois saisons en Pro D2 ponctuées d'une demi-finale en 2017, il signe en Top 14 à Castres où il participe à la conquête du Bouclier de Brennus. En fin de contrat, il signe à Oyonnax en 2019.

Il est prêté pour la saison 2022/2023 à l'USON Nevers Rugby.